CRAN Package Check Results for Package popkin

Last updated on 2022-09-27 11:51:22 CEST.

Flavor Version Tinstall Tcheck Ttotal Status Flags
r-devel-linux-x86_64-debian-clang 1.3.17 26.36 49.15 75.51 NOTE
r-devel-linux-x86_64-debian-gcc 1.3.17 22.54 38.82 61.36 NOTE
r-devel-linux-x86_64-fedora-clang 1.3.17 119.63 NOTE
r-devel-linux-x86_64-fedora-gcc 1.3.17 107.85 NOTE
r-devel-windows-x86_64 1.3.17 33.00 116.00 149.00 ERROR
r-patched-linux-x86_64 1.3.17 25.22 49.76 74.98 OK
r-release-linux-x86_64 1.3.17 25.15 49.26 74.41 OK
r-release-macos-arm64 1.3.17 31.00 NOTE
r-release-macos-x86_64 1.3.17 41.00 NOTE
r-release-windows-x86_64 1.3.17 38.00 109.00 147.00 ERROR
r-oldrel-macos-arm64 1.3.17 31.00 OK
r-oldrel-macos-x86_64 1.3.17 40.00 NOTE
r-oldrel-windows-ix86+x86_64 1.3.17 67.00 135.00 202.00 OK

Check Details

Version: 1.3.17
Check: package dependencies
Result: NOTE
    Package suggested but not available for checking: 'lfa'
Flavors: r-devel-linux-x86_64-debian-clang, r-devel-linux-x86_64-debian-gcc, r-devel-linux-x86_64-fedora-clang, r-devel-linux-x86_64-fedora-gcc, r-release-macos-arm64, r-release-macos-x86_64, r-oldrel-macos-x86_64

Version: 1.3.17
Check: tests
Result: ERROR
     Running 'testthat.R' [10s]
    Running the tests in 'tests/testthat.R' failed.
    Complete output:
     > library(testthat)
     > library(popkin)
     >
     > test_check('popkin')
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     [ FAIL 14 | WARN 26 | SKIP 0 | PASS 539 ]
    
     ══ Failed tests ════════════════════════════════════════════════════════════════
     ── Failure (test_popkin.R:250:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(X)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:255:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(X + 0)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:260:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(2L - X)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:265:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(2 - X)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:271:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(X, m_chunk_max = 1)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:413:5): function returns precomputed values: popkin ──
     `obj <- popkin(X, want_M = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:417:5): function returns precomputed values: popkin ──
     `obj <- popkin(X, subpops, want_M = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:956:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `coancestry2 <- popkin_af(P)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:961:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `obj <- popkin_af(P, want_M = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:968:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `coancestry2 <- popkin_af(P_miss)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:973:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `obj <- popkin_af(P_miss, want_M = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:980:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `obj2 <- popkin_af(t(P_miss), want_M = TRUE, loci_on_cols = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin_BEDMatrix.R:17:9): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(X)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin_fn.R:34:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(Xf, n = n)` produced warnings.
    
     [ FAIL 14 | WARN 26 | SKIP 0 | PASS 539 ]
     Error: Test failures
     Execution halted
Flavor: r-devel-windows-x86_64

Version: 1.3.17
Check: tests
Result: ERROR
     Running 'testthat.R' [11s]
    Running the tests in 'tests/testthat.R' failed.
    Complete output:
     > library(testthat)
     > library(popkin)
     >
     > test_check('popkin')
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     OS - Alias wurde nicht gefunden.
     [ FAIL 14 | WARN 26 | SKIP 0 | PASS 539 ]
    
     ══ Failed tests ════════════════════════════════════════════════════════════════
     ── Failure (test_popkin.R:250:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(X)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:255:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(X + 0)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:260:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(2L - X)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:265:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(2 - X)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:271:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(X, m_chunk_max = 1)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:413:5): function returns precomputed values: popkin ──
     `obj <- popkin(X, want_M = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:417:5): function returns precomputed values: popkin ──
     `obj <- popkin(X, subpops, want_M = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:956:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `coancestry2 <- popkin_af(P)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:961:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `obj <- popkin_af(P, want_M = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:968:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `coancestry2 <- popkin_af(P_miss)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:973:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `obj <- popkin_af(P_miss, want_M = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin.R:980:5): popkin_af works ──────────────────────────────
     `obj2 <- popkin_af(t(P_miss), want_M = TRUE, loci_on_cols = TRUE)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin_BEDMatrix.R:17:9): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(X)` produced warnings.
     ── Failure (test_popkin_fn.R:34:5): function returns precomputed values: popkin_A ──
     `obj <- popkin_A(Xf, n = n)` produced warnings.
    
     [ FAIL 14 | WARN 26 | SKIP 0 | PASS 539 ]
     Error: Test failures
     Execution halted
Flavor: r-release-windows-x86_64